主办单位：洛阳慕臻生物科技有限责任公司

会议简介：

手头没有资源，临床医生如何挖得科研的第一桶金？身处大数据时代，对于从事肿瘤研究的临床医生或科研人员，有没有一种可以既不做实验又不查病史，直接调用公共数据撰写发表 SCI 论文的方法呢？TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库即提供了这样一种可能。TCGA 和 SEER 分别侧重于组学数据和临床数据，各有优势。TCGA（癌症基因组图谱）数据库是一个多组学的数据库，包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据，为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。美国的 SEER（癌症监测、流行病学和结果）数据库则是典型的临床医学数据库，是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一，收集了各个癌种的海量临床病理信息和预后数据，并向全世界免费开放，为临床医师的循证实践及临床研究提供了宝贵的第一手资料。据不完全统计，全世界基于 TCGA 和 SEER 数据挖掘产生的文章已经超过 2000 篇，其中不乏最顶尖的学术期刊文章（如 JAMA、新英格兰、Nature、Cell 等），这一数目还在不断增长中。以往的 TCGA 课程往往侧重于 R 语言程序的讲解，不少学员反应难以掌握。本课程立足应用和实战，宗旨是“临床医生听得懂、学得会，科研人员亦有收获”。本课程将从临床应用视角介绍癌症公共数据库 TCGA、SEER 的基本情况、数据库结构、数据获取方式及基本统计方法等，深度解析近年讲课人发表的基于 TCGA 和 SEER 数据挖掘的经典案例，重点对癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论，最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI 论文撰写策略。

时间地点：2020/11/28--11/29 线上直播

学习目标：

本次培训提供了一次系统掌握 TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及分析流程的机会，目的在于助力有志于利用这些公共数据库的临床医生以及转化研究的科研人员，帮助研究者去更好地挖掘利用这些免费的公共数据。本次培训不侧重于深入的生物信息学分析讲授，拟解决的问题包括：1、如何基于 TCGA 及 SEER 等癌症公共数据库设计课题；2、TCGA 及 SEER 数据库的数据获取；3、获取数据后如何分析；4、如何在此基础上撰写 SCI 论文及申请科研基金。

授课方式：

1、上机操作，2、专题小组研讨与案例讲解分析结合，3、课程讲座；（主题明确，针对性强。专题小组研讨与案例讲解分析结合。）

参会对象：

主要面向从事肿瘤研究的临床医生、转化研究科研人员、在校研究生以及广大临床肿瘤研究领域的科研工作者。

主讲专家:

本次主讲老师是来自国内知名三甲医院肿瘤专业的临床医生和科研工作者，有着丰富的临床和转化研究经验。以一作和通讯作者发表 SCI 论文 26 篇，10 分以上论文 8 篇，累计影响因子 266。其中成功用TCGA、SEER 数据库发表十几篇 SCI，平均影响因子 4.6 分一篇。目前主持国家自然科学基金面上项目及多项省部级人才项目，担任一本 SCI 杂志的 Section editor，以及多本影响因子 5 分以上 SCI 杂志审稿人。

课程大纲：

第一天上午：TCGA 数据库入门

1. 什么是 TCGA？TCGA 数据库基本概念介绍（数据类型、数据级别及barcode）

2. 如何获取 TCGA 数据？（实战）TCGA 数据获取方法（下载单样本数据与汇总数据表）

3. 如何利用 TCGA 数据撰写论文？结合讲者发文案例，进行基于 TCGA 数据库发表文章的深度解析

第一天下午：SEER 数据库入门

1. 什么是 SEER？ SEER 数据库基本概念介绍（数据构成、变量类型）

2. 如何获取 SEER 数据？（实战） SEER 软件安装、权限申请及数据获取

3. 如何利用 SEER 数据撰写论文？结合讲者发文案例，进行基于 SEER 数据库发表文章的深度解析

第二天上午：TCGA 和 SEER 数据深度挖掘

1. 如何深度挖掘公共数据库并进行临床转化课题设计没有资源、资源有限以及资源丰富的三种情况下如何开展转化研究

2. 实战：利用 Excel、SPSS、Graphpad 进行基于 TCGA 数据挖掘

a) 如何实现 TCGA 原始数据的整理

b) 如何使用 Excel 进行不同数据表的拼接

c) 如何在整理数据表基础上进行统计分析和作图

3. 实战：利用 R 程序进行 TCGA 和SEER 数据挖掘

a) R 语言基础知识

b) 如何利用 R 程序实现单个样本文件的拼接和计算

c) 如何利用 R 程序进行图形制作

d) 如何利用 R 程序制作 nomogram

第二天下午：论文标书撰写与实用统计方法

1. SCI 论文撰写技巧

a) SCI 论文框架与写作思路

b) SCI 论文图表制作技巧

c) 如何撰写 Cover Letter 并在修回时与审稿人有效沟通

2. 实用科研统计方法实战以 GraphPad 和 SPSS 软件使用为例，介绍：

a) 直方图、散点图、折线图、生存曲线、热图等常用统计图形制作

b) t 检验、ANOVA、卡方检验、单因素及多因素生存分析

3. 医学基金标书撰写技巧 结合国自然面上项目成功中标实例和评审经验

4. 现场答疑

对学员提出的问题进行详细解答并对 2 天课程内容进行补充延申

备注：自备 WINDOWS 操作系统笔记本电脑，需要安装 SPSS、R/R studio、GraphPad Prism、SEER*Stat 以

及 Office Excel 2007 以上版本等软件。

参会费用：

2800 元/人（含会议费、会务费、会议注册费、资料费等）

优惠政策：

1：在读学生凭有效在读证明或学生证减免 200 元

2：11 月 1 日前报名并缴费的学员减免 200 元

3：3 人团报，每人减免 200 元