主办单位:上海循掘生物科技中心
【会议背景】单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此,单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。通过单细胞测序可以最大程度的反映细胞的异质性,发现新的细胞群和细胞亚群,并为阐明细胞状态转换的调控机理提供了技术保障。单细胞技术以及数据分析方法在肿瘤、发育生物学、免疫学、神经科学等领域有重要应用,是现今生命科学研究的焦点。
常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学、肿瘤微环境等领域的研究利器。
【主要内容】详细内容见课表
1.熟悉单细胞组学图表解读和研究思路。
2.掌握单细胞组学分析标准流程和常用软件。
3.熟悉单细胞数据的分型和marker基因鉴定。
4.掌握单细胞数据的轨迹分析及功能富集分析。
5.了解单细胞课题设计方法及研究思路。
6.熟悉并掌握单细胞空间转录组学实用技能
【讲师背景】
来自中科院,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇,承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。